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新冠病毒药物研发分秒必争

发布时间:2021-02-26 17:01:17 所属栏目:传媒 来源:互联网
导读:合物发现阶段,以往的方法是通过大量实验做筛选,发现可能适合的化合物。如今,科学家尝试通过机器模拟分子化合物与靶点的相互作用,从而筛选出可能有效的化合物做实验。 在此过程中,高性能计算(HighPerformance Computing,简称HPC),常被称为超算,是现代

合物发现阶段,以往的方法是通过大量实验做筛选,发现可能适合的化合物。如今,科学家尝试通过机器模拟分子化合物与靶点的相互作用,从而筛选出可能有效的化合物做实验。

在此过程中,高性能计算(HighPerformance Computing,简称HPC),常被称为“超算”,是现代药物研发必不可少的支持。

云计算的兴起更是改变了科学家获取算力、享受超算服务的方式。比如阿里云E-HPC 云超算产品,能够让科学家自助在云上搭建高性能集群系统,满足药物研发人员对计算平台的需求。

此外,云上算力规模庞大且灵活,科学家可以按需购买,而不用担心被算力规模限制了研发速度。

那么,具体病毒、药物研发和高性能计算之间具体联系几何?我们将从从病毒如何在宿主复制扩散开始讲起,到药物抑制方法举例,最后给出高性能计算在药物研发的作用。

病毒和药物研发

病毒是由核酸分子(DNA或RNA)与蛋白质构成的非细胞形态,如下图烟草花叶病毒所示。因为是非细胞的,无法通过细胞分裂的方式来完成数量增长,它们通过进入宿主细胞并利用宿主细胞内的代谢工具来合成自身的拷贝,并完成病毒的组装[1]。冠状病毒(CoV)是一种是一组高度同源的,单链正译RNA病毒,其具有以上的病毒特征,可引起多种严重程度不同的呼吸道,肠道,肝脏和神经系统疾病,在过去的12年中出现的两种新型的,即严重的急性呼吸系统综合症(SARS-CoV)和中东呼吸系统综合症(MERS-CoV)[2],以及目前肆掠的COVID-19都属于这种病毒

(编辑:广安站长网)

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